มีหลากหลายชนิดให้เลือกใช้ เช่นที่ทำจากใยผ้า ใยกระดาษ หรือ ใยโฟม แต่แนะนำให้เลือกใช้ชนิดที่ทำจากวัสดุที่สามารถล้างทำความสะอาดได้อย่างพลาสติกเช่น nylon หรือ วัสดุโลหะอย่างเช่น aluminium เป็นต้น

เครื่องฟอกอากศที่ใช้ไส้กรองประเภทนี้ มักจะใช้ร่วมกับไส้กรองละเอียดอื่นๆ จึงแนะนำให้ทำความสะอาดวัสดุใยกรองบ่อยๆ เช่นอาทิตย์ละครั้ง เพื่อลดภาระการดักจับฝุ่นช่วยยืดอายุของไส้กรอง ละเอียดในชั้นต่อๆไป

สำหรับไส้กรองละเอียดชนิดนึงที่หลายคนคุ้นเคยคือ HEPA Filter ซึ่งทำจากเส้นใย Fiberglass มีความสามรถในการกรองได้ 99.95% ที่ความละเอียด 0.3 µm ซึ่งเป็นไส้กรองประสิทธิภาพใช้ในระดับอุตสาหกรรมห้องปลอดฝุ่น และห้องปลอดเชื้อในโรงพยาบาล แต่มีไส้กรองที่มีประสิทธิภาพใกล้เคียงกันอีกชนิดเรียกว่า semi-HEPA หรือ HEPA-type ซึ่งมีความสามารถกรองได้ 99% ที่ความละเอียด 0.5 µm จึงสามารถกรองฝุ่นในระดับ PM 2.5 ได้อย่างดีเยี่ยม

ระบบไส้กรองเครื่องฟอกอากาศอีกชนิดนึงคือ Electrostatic Precipitator (ESP) เป็นระบบไส้กรองที่ใช้กรองฝุ่นควันละเอียดได้อย่างมีประสิทธิภาพอีกชนิด ใช้วิธีการสร้างสนามแม่เหล็กไฟฟ้าดักจับฝุ่นไว้ที่ตัวไส้กรอง ข้อดีของไส้กรองอากาศชนิดนี้อีกชนิดอย่างก็คือสามารภทำความสะอาดได้จึงไม่มีค่าใช้จ่ายสิ้นเปลีอง